Abertura: A Infância de Alex
O filme começa com um flashback na savana africana, mostrando o pequeno leão Alex, originalmente chamado de Alakay, vivendo com seus pais, Zuba e Florrie. Durante uma brincadeira com o pai, Alex é capturado por caçadores e colocado em uma caixa. Essa caixa cai no mar e, levada pela correnteza, acaba chegando até Nova Iorque, onde Alex cresce e se torna o famoso leão do Zoológico do Central Park. Essa abertura dá o tom emocional da história, mostrando as origens de Alex e sua ligação perdida com a família.
O Retorno a Nova Iorque
De volta ao presente, depois das aventuras em Madagascar, Alex, Marty, Melman e Glória querem voltar para casa, em Nova Iorque. Com a ajuda dos pinguins — Capitão, Kowalski, Rico e Recruta — eles consertam um velho avião. Juntam-se a eles o Rei Julien, Maurice e até Mort, além das galinhas que estavam em Madagascar. Com a decolagem atrapalhada e desajeitada, eles conseguem levantar voo, mas o avião não resiste por muito tempo e acaba caindo no meio da África.
A Chegada à Savana
Para surpresa de todos, o grupo cai justamente na savana africana, um local cheio de animais selvagens. Cada personagem encontra algo que conecta sua personalidade à vida natural. Alex descobre que está na terra de seus pais e reencontra Zuba e Florrie, que ficam emocionados, mas confusos, por ele ter virado um leão “domesticado” de zoológico. Marty encontra uma manada de zebras que parecem e falam exatamente como ele, deixando-o inseguro sobre sua individualidade. Glória conhece hipopótamos machos, sendo cortejada especialmente por Moto Moto, um hipopótamo galanteador e narcisista. Já Melman, hipocondríaco como sempre, é tratado como médico da comunidade de girafas por conhecer tantos “remédios” do zoológico.
O Conflito de Alex
Zuba, o pai de Alex, quer que o filho se torne parte da comunidade e herdeiro do clã dos leões. Porém, Makunga, um leão invejoso e manipulador, desafia Alex para o ritual de iniciação, no qual ele deve derrotar um adversário. Alex, acostumado com danças e performances de zoológico, não entende a seriedade da luta e tenta entreter com passos de dança. A derrota o ridiculariza, e Zuba, envergonhado, é forçado a se afastar dele. Makunga se aproveita da situação e se torna o novo líder da alcateia de leões.
Os Pinguins e a Construção da Vida de Luxo
Enquanto isso, os pinguins começam a reparar o avião usando peças improvisadas. Para conseguir peças e combustível, eles se envolvem em um casamento relâmpago com as galinhas do avião, além de formar um pequeno império de cassino improvisado, mostrando mais uma vez sua habilidade em dominar qualquer situação.
O Romance e a Insegurança de Glória e Melman
Glória se deixa encantar pelas tentativas de Moto Moto, mas percebe que ele só se interessa por sua aparência. Melman, apaixonado por Glória, sofre em silêncio, acreditando que vai morrer por conta de sua hipocondria. Em um momento dramático, ele se prepara até para se sacrificar na fogueira de cura das girafas, mas Glória o impede e finalmente percebe seus sentimentos genuínos.
O Dilema de Marty
Marty passa por uma crise de identidade, já que todas as zebras da savana parecem iguais. Ele começa a achar que perdeu sua singularidade, mas Alex, em um gesto de amizade verdadeira, prova que o reconhece entre todas as zebras por causa da conexão deles. Esse momento reforça a importância da amizade acima das aparências.
A Escassez de Água
Um grande problema surge: o rio da savana seca, colocando em risco a vida de todos os animais. Alex descobre que os caçadores humanos desviaram o curso do rio com uma represa. Com coragem, ele decide enfrentar o perigo e salvar a comunidade. Mesmo tendo sido rejeitado por Makunga e pelos leões, Alex mostra seu verdadeiro valor.
A Prova de Coragem de Alex
Alex, com a ajuda de Marty, Glória e Melman, elabora um plano arriscado para destruir a represa. Eles enfrentam os caçadores, liberam a água e restauram a vida na savana. Esse ato heroico finalmente faz com que Zuba reconheça o verdadeiro valor do filho, não como um guerreiro no sentido tradicional, mas como um líder com coração e coragem.
A Queda de Makunga
Com o retorno da água e a vitória de Alex, os animais percebem que Makunga não é digno de liderança. Em uma cena cômica e simbólica, o Rei Julien, em sua mania de rituais bizarros, envolve Makunga em uma “oferta” de sacrifício para uma divindade fictícia, e o leão arrogante acaba sendo ridicularizado diante de todos.
A Conclusão: Um Novo Lar
Ao final, Alex se reconcilia com seus pais e encontra paz com sua identidade de leão e artista. Marty recupera sua confiança e percebe que sua individualidade não depende da aparência. Glória e Melman assumem seu amor. Os pinguins terminam o conserto do avião, mas o grupo decide permanecer mais tempo na África, percebendo que ali também pode ser um lar.
