Abertura: O Mistério do Obscurus
O filme começa em 1926, com uma sequência sombria que mostra jornais do mundo bruxo noticiando ataques misteriosos que abalam a comunidade mágica. Ao mesmo tempo, é revelado o perigo representado por um bruxo das trevas chamado Gerardo Grindelwald, que desapareceu após causar destruição pela Europa.
Em Nova York, algo estranho vem atacando as ruas: uma força invisível e destrutiva, mais tarde revelada como um Obscurus, entidade criada quando uma criança bruxa reprime sua magia.
A Chegada de Newt Scamander
No porto de Nova York, chega Newt Scamander, um jovem magizoologista britânico que carrega consigo uma maleta encantada, maior por dentro do que por fora, cheia de criaturas mágicas que ele estuda e protege.
Newt planeja ficar apenas de passagem nos Estados Unidos para libertar uma de suas criaturas, o Trovão chamado Frank, no deserto do Arizona. No entanto, as coisas não saem como o esperado.
O Encontro com Jacob Kowalski
Newt, ao tentar recuperar um pelúcio (Niffler), criatura que adora objetos brilhantes e escapa de sua maleta, entra em um banco. Lá, ele conhece Jacob Kowalski, um humano (ou “trouxa”, nos EUA chamados de não-bruxos) que sonha em abrir uma padaria.
Por engano, Jacob acaba levando a maleta de Newt e libertando várias criaturas mágicas pela cidade. Isso coloca Newt em apuros com as autoridades bruxas.
A Intervenção de Tina Goldstein
Enquanto tenta resolver a confusão, Newt é detido por Porpentina "Tina" Goldstein, uma ex-auror que trabalha no Congresso Mágico dos Estados Unidos (MACUSA), liderado pela presidente Seraphina Picquery.
Tina leva Newt ao MACUSA, mas sua credibilidade é baixa porque ela já havia sido rebaixada no trabalho. O incidente não ajuda: as autoridades estão mais preocupadas com os ataques do Obscurus e com a ameaça de Grindelwald.
O Mundo da Maleta Encantada
Depois de escapar junto com Jacob, Newt mostra ao padeiro seu mundo dentro da maleta. Ali vivem diversas criaturas mágicas: o majestoso Erumpente, a travessa Occami, o invisível Demiguise, os fofos mas perigosos Escarbatos, entre outros.
Jacob, maravilhado, se encanta especialmente com o cuidado que Newt tem por cada animal, entendendo que, ao contrário do que muitos bruxos acreditam, eles não são monstros, mas seres incríveis.
A Ascensão de Credence Barebone
Paralelamente, conhecemos Credence Barebone, um jovem oprimido pela líder fanática da organização anti-bruxaria Segunda Salém, Mary Lou Barebone. Credence sofre maus-tratos constantes, e sua repressão mágica o torna o hospedeiro de um poderoso Obscurus, embora ele ainda não saiba.
O auror Percival Graves, braço direito da presidente do MACUSA, manipula Credence prometendo ajudá-lo, mas na verdade deseja usar o Obscurus como arma.
Queenie e a Conexão com Jacob
Newt e Tina se aproximam da irmã de Tina, Queenie Goldstein, uma legilimente (capaz de ler mentes). Jacob e Queenie desenvolvem uma química imediata e um romance improvável começa a florescer entre eles, trazendo momentos de leveza e humor à trama.
A Caça às Criaturas
Boa parte do filme se dedica à caçada de Newt, Tina, Queenie e Jacob pelas criaturas que escaparam. Cada captura é uma cena criativa, misturando aventura e comédia, como a perseguição ao Erumpente no zoológico e a tentativa de pegar o Occami, que cresce ou diminui de tamanho conforme o espaço ao redor.
Essas sequências também reforçam a mensagem central de Newt: os animais não são ameaças, mas vítimas do medo e da ignorância humana.
O Obscurus Revelado
À medida que os ataques em Nova York aumentam, fica claro que a ameaça não vem das criaturas de Newt, mas do Obscurus. Newt revela ao grupo que já estudou a entidade na África, conseguindo isolá-la de uma criança, embora a experiência tenha sido trágica.
Quando Graves acusa Newt injustamente de ser responsável pela destruição na cidade, ele é preso pelo MACUSA junto com Tina. Apenas Jacob e Queenie conseguem escapar.
A Verdade sobre Credence
No clímax, descobrimos que o verdadeiro hospedeiro do Obscurus é Credence, não a irmã mais nova como Graves insinuava. Credence libera toda a sua fúria reprimida pelas ruas de Nova York, destruindo quarteirões inteiros.
Graves tenta manipular o jovem ainda mais, mas Newt e Tina conseguem acalmar Credence, mostrando compaixão e empatia.
A Batalha Final e a Revelação de Grindelwald
O MACUSA intervém de forma violenta, destruindo o Obscurus e aparentemente matando Credence, para horror de Newt e Tina.
Em seguida, Newt confronta Graves, revelando-o como o verdadeiro inimigo. Usando sua maleta e feitiços habilidosos, Newt derrota Graves, e os aurores o prendem. Nesse momento, a ilusão se desfaz: Graves na verdade é Gerardo Grindelwald disfarçado, que vinha manipulando todos desde o início.
A Restauração da Cidade
Com a ajuda de Frank, o Trovão que Newt pretendia libertar, e de uma poderosa tempestade mágica, a comunidade bruxa consegue apagar as memórias dos não-bruxos da cidade sobre os acontecimentos. A chuva enfeitiçada faz todos esquecerem a destruição causada.
Infelizmente, isso significa que Jacob também deve perder suas lembranças, o que deixa Queenie devastada. Ele retorna à sua vida como padeiro, mas, de forma sutil, ainda guarda traços de suas experiências mágicas, criando doces em formatos de criaturas.
Epílogo: A Partida de Newt
Antes de partir de volta para a Inglaterra, Newt promete a Tina que voltará para vê-la e talvez mostrar seu livro — justamente o futuro “Animais Fantásticos e Onde Habitam”, que dará título ao filme.
O longa encerra com o tom de esperança e de novos começos, mas também com a ameaça sombria de Grindelwald ainda à solta, preparando o terreno para as continuações.
