Abertura: O Fim de Krypton
O filme começa em Krypton, um planeta tecnologicamente avançado, mas condenado pela exploração descontrolada de seus recursos naturais. O cientista Jor-El e sua esposa Lara Lor-Van decidem salvar seu filho recém-nascido, Kal-El, enviando-o em uma cápsula espacial rumo à Terra. Esse ato ocorre em meio a uma rebelião liderada pelo general Zod, que deseja controlar Krypton à força.
Jor-El coloca no corpo de seu filho o códice genético de toda a raça kryptoniana, garantindo que Kal-El carregue a esperança de seu povo. Zod tenta impedir a fuga, mas Kal-El consegue escapar. Como punição por sua traição, Zod e seus seguidores são aprisionados na Zona Fantasma, enquanto Krypton finalmente explode.
A Infância de Clark Kent
O bebê Kal-El pousa no planeta Terra, onde é encontrado pelo casal de fazendeiros Jonathan e Martha Kent, em Smallville, Kansas. Eles o batizam de Clark Kent e o criam como seu próprio filho. Desde cedo, Clark percebe que é diferente: possui superforça, visão de raio-x, superaudição e invulnerabilidade.
Jonathan o ensina a controlar seus poderes e o alerta para manter sua verdadeira origem em segredo, temendo que a humanidade não esteja pronta para aceitá-lo. Essa dualidade acompanha Clark durante toda sua juventude: o desejo de ajudar os outros versus o medo de ser rejeitado.
A Busca por Identidade
Já adulto, Clark vaga pelo mundo em busca de propósito, vivendo com identidades temporárias e ajudando pessoas em segredo. Durante uma missão de resgate em um navio, ele chama a atenção da repórter Lois Lane, do jornal Planeta Diário, que começa a investigar sua existência misteriosa.
Clark descobre uma nave kryptoniana enterrada no gelo no Ártico. Dentro dela, encontra uma consciência digital de Jor-El, que lhe revela sua verdadeira origem e seu nome kryptoniano: Kal-El. Jor-El explica o significado de seu envio à Terra — ser uma ponte entre dois mundos e um símbolo de esperança.
A Ameaça de Zod
Enquanto Clark encontra respostas, o general Zod escapa da Zona Fantasma com seus seguidores e chega à Terra. Ele exige que Kal-El se entregue, ameaçando destruir o planeta caso isso não aconteça. Clark, agora mais consciente de seu papel, decide enfrentar Zod, mesmo ainda incerto de sua aceitação pela humanidade.
Lois Lane é envolvida no conflito e acaba sendo salva por Clark em diversas ocasiões, criando um elo de confiança entre eles.
O Conflito Entre Dois Mundos
Zod revela seu plano: usar a Terra como um novo Krypton. Ele pretende ativar a Máquina de Terra-formação, que alteraria a atmosfera e a gravidade do planeta, tornando-o habitável para kryptonianos, mas mortal para os humanos. Para Zod, a sobrevivência de seu povo justifica qualquer sacrifício.
Clark, assumindo finalmente sua identidade de Superman, alia-se aos militares da Terra e a Lois para impedir a destruição do planeta. Surge um dilema: seguir seu destino como kryptoniano ao lado de Zod ou proteger sua casa adotiva, a Terra.
A Batalha de Smallville
O primeiro grande confronto acontece em Smallville, quando Zod e seus guerreiros enfrentam Superman em combate aberto. A cidade sofre enorme destruição, mas Clark consegue deter parte das forças de Zod. No entanto, os humanos também passam a temê-lo, devido à devastação causada pela batalha.
Jonathan Kent, antes de morrer em um tornado, já havia pedido a Clark que escolhesse com sabedoria quando revelar sua verdadeira identidade. Esse conselho guia Clark em suas decisões.
O Plano para Salvar a Terra
Com a ajuda da nave kryptoniana e das informações de Jor-El, Superman e os militares desenvolvem um plano: criar uma reação entre a cápsula que trouxe Kal-El à Terra e a nave de Zod, gerando uma singularidade capaz de sugar os invasores de volta para a Zona Fantasma.
Lois participa ativamente do plano, mostrando sua coragem e proximidade crescente com Clark. Durante a operação, ela quase morre, mas é salva por Superman, fortalecendo o laço entre eles.
O Duelo Final
Com seus soldados derrotados e sua nave destruída, resta apenas Zod, que enfrenta Superman em uma batalha devastadora por Metrópolis. O confronto é brutal, mostrando a fúria e a habilidade militar de Zod contra a compaixão e determinação de Superman.
No clímax, Zod tenta matar inocentes com sua visão de calor. Para impedir o massacre, Superman é forçado a tomar uma decisão extrema: ele quebra o pescoço de Zod, matando-o. Esse ato o traumatiza, mas também marca sua escolha definitiva de defender a humanidade, mesmo contra seu próprio povo.
O Nascimento do Superman
Após a batalha, Clark decide criar uma identidade civil para viver entre os humanos. Ele passa a trabalhar como repórter no Planeta Diário, ao lado de Lois Lane, que guarda seu segredo.
Superman encontra sua missão: ser um guardião da Terra, um símbolo de esperança e justiça. Apesar das desconfianças e do medo que ainda gera, ele promete proteger a humanidade a qualquer custo.