A Fuga de Grindelwald
O filme começa em Nova York, em 1927. O poderoso bruxo das trevas Gerardo Grindelwald (Johnny Depp) está preso na sede do Congresso Mágico dos Estados Unidos (MACUSA). Ele é transferido para outra prisão, mas consegue escapar de forma espetacular durante o trajeto, usando seus seguidores e criaturas mágicas para enganar os guardas. Grindelwald mata brutalmente os bruxos que o transportavam e foge para a Europa, jurando reunir seguidores para impor sua visão de supremacia bruxa sobre os “não-mágicos”.
A Missão de Newt Scamander
De volta a Londres, Newt Scamander (Eddie Redmayne) enfrenta problemas com o Ministério da Magia britânico, que tenta controlar suas viagens após os acontecimentos do primeiro filme. Ele recebe a visita de Alvo Dumbledore (Jude Law), seu antigo professor de Hogwarts. Dumbledore pede que Newt ajude a localizar Credence Barebone (Ezra Miller), o jovem obscurial que sobreviveu em Nova York e que agora está desaparecido em Paris. Grindelwald acredita que Credence é a chave para derrotar Dumbledore, e por isso ambos estão atrás dele.
O Retorno de Jacob e Queenie
Enquanto isso, Newt reencontra seus amigos americanos: Jacob Kowalski (Dan Fogler), o trouxa simpático que teve a memória apagada, mas que voltou a se lembrar de tudo, e Queenie Goldstein (Alison Sudol), bruxa legilimente apaixonada por ele. Jacob e Queenie estão juntos, mas seu relacionamento é proibido pelas leis mágicas, já que bruxos e trouxas não podem se casar. Isso gera conflitos, e Queenie, fragilizada, começa a ser influenciada pelas promessas de liberdade feitas por Grindelwald.
A Chegada em Paris
Credence viaja para Paris em busca de sua verdadeira identidade, acompanhado por Nagini (Claudia Kim), uma jovem amaldiçoada que pode se transformar em cobra — a mesma Nagini que, no futuro, se tornará a fiel serva de Voldemort. Em Paris, eles são perseguidos por caçadores de bruxos e pelo Ministério da Magia francês, mas Credence continua obcecado em descobrir quem são seus pais.
Ao mesmo tempo, Newt e Jacob também viajam para Paris, tentando encontrá-lo antes que Grindelwald consiga manipulá-lo.
Leta Lestrange e os Segredos do Passado
No Ministério francês, surge a figura de Leta Lestrange (Zoë Kravitz), ex-noiva de Newt e agora noiva de seu irmão, Theseus Scamander (Callum Turner). Leta é atormentada por um segredo de infância: quando criança, ela trocou seu irmão bebê, Corvus Lestrange, em um navio que naufragou. A culpa a consome, e muitos acreditam que Credence pode ser esse irmão perdido, sobrevivente misterioso da tragédia.
A Conspiração de Grindelwald
Grindelwald organiza uma grande reunião em um cemitério em Paris, atraindo bruxos de toda a Europa. Lá, ele revela seus planos de dominação mundial: quer que os bruxos governem os trouxas, alegando que, se isso não acontecer, guerras devastadoras como a Primeira Guerra Mundial e a futura Segunda Guerra Mundial destruirão o mundo. Sua retórica seduz muitos seguidores.
Durante esse encontro, Queenie, fragilizada pelo preconceito contra sua relação com Jacob, decide se juntar a Grindelwald, acreditando que ele trará liberdade para amores proibidos.
O Sacrifício de Leta
No cemitério, ocorre uma batalha intensa entre os seguidores de Grindelwald e os bruxos que tentam detê-lo, incluindo Newt, Tina (Katherine Waterston), Jacob e Theseus. Grindelwald usa um feitiço de fogo azul mortal para eliminar seus inimigos, mas deixa uma saída para os que quiserem se juntar a ele.
Nesse momento, Leta Lestrange se sacrifica para proteger Newt e Theseus, enfrentando Grindelwald diretamente. Ela morre diante deles, reforçando o peso de seu passado e sua culpa.
A Revelação sobre Credence
No clímax, Grindelwald finalmente consegue atrair Credence para o seu lado. Ele o convence de que é especial e revela uma informação bombástica: seu verdadeiro nome seria Aurelius Dumbledore, suposto irmão perdido de Alvo Dumbledore. Essa revelação abala todos, já que ninguém sabia da existência de tal irmão. Grindelwald promete a Credence que ele será capaz de derrotar Dumbledore.
O Final em Hogwarts
Após os eventos, Newt retorna a Hogwarts para se encontrar com Dumbledore. Ele entrega ao professor uma prova crucial: o sangue pactuado entre Dumbledore e Grindelwald em um pacto de sangue mágico. Esse artefato impede que os dois lutem um contra o outro, explicando por que Dumbledore nunca o enfrentou diretamente. Agora, com o pacto em mãos, há esperança de que ele possa ser destruído no futuro, permitindo que o confronto entre eles aconteça.
Epílogo Sombrio
O filme termina com Grindelwald reunindo seus seguidores em um novo quartel-general, incluindo Queenie e Credence, agora sob seu comando. Do outro lado, Dumbledore, Newt e seus aliados se preparam para a guerra que está por vir, deixando claro que a batalha pelo futuro do mundo mágico está apenas começando.